बागेश्वर धाम के पीठाधीश्वर पंडित धीरेंद्र कृष्ण शास्त्री के समर्थन में पुरी पीठ के शंकराचार्य स्वामी निश्चलानंद सरस्वती भी खड़े हुए हैं. शंकराचार्य स्वामी निश्चलानंद सरस्वती ने पंडित धीरेंद्र कृष्ण शास्त्री को अपना प्रिय और लाडला बताया है. शंकराचार्य ने कहा है कि पंडित धीरेंद्र कृष्ण शास्त्री सनातन धर्म के लिए अच्छा कार्य कर रहे हैं. उन्होंने कहा कि शंकराचार्य होने के नाते वे उनकी आलोचना या समीक्षा नहीं करेंगे. लेकिन पंडित धीरेंद्र कृष्ण शास्त्री हिंदुओं को जगाने का काम कर रहे हैं, वे एक बार उनसे मिलने भी आए थे. शंकराचार्य स्वामी निश्चलानंद सरस्वती ने कहा कि वह उन पर टिप्पणी करना उचित नहीं समझते. धीरेंद्र कृष्ण शास्त्री समाज और सनातन धर्म के लिए अच्छा काम कर रहे हैं. दूसरी ओर, शंकराचार्य स्वामी निश्चलानंद सरस्वती ने कहा कि उन्हें उम्मीद नहीं है कि कोई राजनीतिक दल भारत को हिंदू राष्ट्र घोषित करने की मांग करेगा. शंकराचार्य स्वामी निश्चलानंद सरस्वती ने अठारह महीने पहले विश्व स्तर पर भारत को एक हिंदू राष्ट्र कहना शुरू किया है, उन्होंने कहा कि वह जो कहते हैं वह कहते हैं.